RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	MYOG	P15173	224 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	S1PR1	P21453	382 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ACHE	P22303	614 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GP5	P40197	560 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	MTHFR	P42898	656 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ISL1	P61371	349 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	RBP5	P82980	135 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	BNC1	Q01954	994 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	BFSP1	Q12934	665 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SCARB2	Q14108	478 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SLC39A14	Q15043	492 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	VMP1	Q96GC9	406 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SCMH1	Q96GD3	660 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SFXN2	Q96NB2	322 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	MIOS	Q9NXC5	875 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	MALT1	Q9UDY8	824 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	RIPK3	Q9Y572	518 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.92	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	LAMA4	Q16363	1823 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	OR5K3	A6NET4	321 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	T	O15178	435 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TECTA	O75443	2155 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	GH1	P01241	217 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	IFNAR1	P17181	557 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SLC9A3	P48764	834 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CAPZA1	P52907	286 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CNTN2	Q02246	1040 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	RBPJ	Q06330	500 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TRAF3	Q13114	568 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	PTPRCAP	Q14761	206 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TRNP1	Q6NT89	227 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SFR1	Q86XK3	245 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	RDM1	Q8NG50	284 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SEPT8	Q92599	483 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	PHF21A	Q96BD5	680 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	SPDL1	Q96EA4	605 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	OLFM1	Q99784	485 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	NEURL2	Q9BR09	285 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	NAPB	Q9H115	298 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CACNA1H	O95180	2353 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		3.91	□□□□□ -1.78

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