RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517514.1

CLN8-202, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 4

Gene CLN8, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-202ENST00000517514 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CCKBRP32239 447 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 NAGLUP54802 743 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CDH13P55290 713 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 HERVK_113P63132 956 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CSNK1G2P78368 415 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CDC16Q13042 620 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TRAF3Q13114 568 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PRKAA1Q13131 559 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 DPH7Q9BTV6 452 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 FAM149AA5PLN7 773 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 AGRPO00253 132 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 HAT1O14929 419 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 CCND1P24385 295 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 ABATP80404 500 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 DOC2AQ14183 400 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 KCNAB1Q14722 419 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PDK4Q16654 411 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 CARFQ8N187 725 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-202ENST00000517514 CCDC63Q8NA47 563 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 MGARPQ8TDB4 240 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PMEPA1Q969W9 287 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 HAUS8Q9BT25 410 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.49□□□□□ -0.89
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