RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 SORT1Q99523 831 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF98A6NK75 572 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 SCAMP1O15126 338 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 VAPBO95292 243 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PTTG1O95997 202 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DQB2P05538 268 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 DDOSTP39656 456 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PIK3CBP42338 1070 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 AIF1P55008 147 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CASP9P55211 416 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PIGFQ07326 219 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 GRM7Q14831 915 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 METTL4Q8N3J2 472 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 TESCQ96BS2 214 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CHFRQ96EP1 664 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 OR52B2Q96RD2 323 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 DIABLOQ9NR28 239 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ADA2Q9NZK5 511 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 NUP205Q92621 2012 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ANK1P16157 1881 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 M0R3G1 203 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 LAMP2P13473 410 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 IL12AP29459 219 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 RING1Q06587 406 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 BCL2L1Q07817 233 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 RUNX3Q13761 415 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 SQLEQ14534 574 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CDH24Q86UP0 819 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 MAPK15Q8TD08 544 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 KLK6Q92876 244 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ARL5BQ96KC2 179 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ASB16Q96NS5 453 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 OPALINQ96PE5 141 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 SMIM14Q96QK8 99 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 UCK2Q9BZX2 261 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 DSN1Q9H410 356 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF175Q9Y473 711 aa7.04□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ANTXRLA6NF34 631 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 KPNA5O15131 536 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CDK14O94921 469 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 YES1P07947 543 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 HLA-FP30511 346 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 SLC7A1P30825 629 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ELK3P41970 407 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 WNT3AP56704 352 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 FAM189A2Q15884 450 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 COLEC12Q5KU26 742 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 CPT1BQ92523 772 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 MARVELD3Q96A59 401 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 MSANTD3Q96H12 275 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 NPAS2Q99743 824 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 BEX2Q9BXY8 128 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 COG4Q9H9E3 785 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 COL4A6Q14031 1691 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 TRIM38O00635 465 aa7.03□□□□□ -1.28
ROBO1-211ENST00000498428 FPGTO14772 594 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms