RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf111Q8N326 155 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF583Q96ND8 569 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD244Q9BZW8 370 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FANCEQ9HB96 536 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGES3LE9PB15 166 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XYLBO75191 536 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELFN1P0C7U0 828 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TACR1P25103 407 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBA4AP68366 448 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBED5Q49AG3 693 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPS4Q9NQG7 708 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL36AQ9UHA7 158 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRAK3Q9Y616 596 aa15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPOPA6NHQ4 379 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01565O15544 149 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK16O75716 305 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH1P12830 882 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NNMTP40261 264 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP107P57740 925 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BNIP3Q12983 259 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PWP1Q13610 501 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROSER1Q86XN7 944 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOR3AQ9H497 397 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS4AQ9UN37 437 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OARD1Q9Y530 152 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.05■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HS6ST1O60243 411 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4F3Q08477 520 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARTPTQ16568 116 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEP1AQ16819 746 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR180Q86V85 440 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF13Q92913 245 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP2M1Q96CW1 435 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRYLO94915 3013 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MUC3AQ02505 3323 aa15.05■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 G3V2T6 193 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS14O43566 566 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGTAO43765 313 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DIRAS1O95057 198 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDYNP01213 254 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGRP06401 933 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSH3P20585 1137 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK8P45983 427 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPIDRQ14159 915 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MACC1Q6ZN28 852 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOTOA8MTQ0 251 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BMQ9 156 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD28O15084 1053 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR56A5P0C7T3 313 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THRBP10828 461 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4B1P13584 511 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB42P16452 691 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNPDA1P46926 289 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAC14Q08AM6 782 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHHQ15465 462 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPEARQ8WU66 669 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2H4Q92759 462 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC47A1Q96FL8 570 aa15.04■□□□□ -0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms