RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLGN3Q9NZ94 848 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF221Q9UK13 617 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA2Q9UM82 520 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFU1Q9UMS0 254 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SATB2Q9UPW6 733 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCML2Q9UQR0 700 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2orf16Q68DN1 1984 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARD3Q8TEW0 1356 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPG2P98160 4391 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM149AA5PLN7 773 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NDX4 124 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3KTA2 159 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPAA1O43292 621 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 HBP1O60381 514 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG7O75391 227 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK2AP2O75956 126 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD4P01730 458 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCKP08631 526 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-31P0DP07 118 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADRB3P13945 408 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNCP24863 283 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACADLP28330 430 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPD2P43304 727 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEA9P43362 315 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTNR1AP48039 350 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCP4P48539 62 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRISP3P54108 245 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIO3P55073 304 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAX2Q02962 417 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTKQ06187 659 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERINC3Q13530 473 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTRK2Q16620 822 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC5A9Q2M3M2 681 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB116Q30KQ4 102 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGGQ5H8A4 983 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A53Q5H9E4 307 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3orf38Q5JPI3 329 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAQR9Q6ZVX9 377 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATG9AQ7Z3C6 839 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRINAQ7Z429 371 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D26Q86UD7 250 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 AACSQ86V21 672 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF429Q86V71 674 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 VSIG1Q86XK7 387 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC28AQ8IWP9 274 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8N9W7 124 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPPL3Q8TCT6 385 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR60Q8WVS4 1066 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM210BQ96KR6 192 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CGRRF1Q99675 332 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXC2Q99958 501 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RACGAP1Q9H0H5 632 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF702PQ9H963 129 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR108Q9NPR9 543 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLQ9UEF7 1012 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNPY2Q9Y2B0 182 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DTNAQ9Y4J8 743 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRFAP1Q9Y605 127 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RYR3Q15413 4870 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLG5Q8TDM6 1919 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOCK9Q9BZ29 2069 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CREBBPQ92793 2442 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHTN1A0MZ66 631 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKX2-6A6NCS4 301 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGAP5A6NIR3 686 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC38A8A6NNN8 435 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 B4GALT5O43286 388 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP23AO75900 390 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 AIFM1O95831 613 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 H1F0P07305 194 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYL1P12980 280 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 HRH2P25021 359 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTGER4P35408 488 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLSTP36957 453 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC7A2P52569 658 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF131P52739 623 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SORDQ00796 357 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL30Q0D2K2 578 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 STRN3Q13033 797 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRMP1Q14194 572 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 VWC2Q2TAL6 325 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 INAVAQ3KP66 663 aa-1.31□□□□□ -2.62
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