RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa13.38□□□□□ -0.27
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CTIF-202ENST00000382998 CORINQ9Y5Q5 1042 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.36□□□□□ -0.27
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CTIF-202ENST00000382998 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 29.8
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