RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 PQLC1Q8N2U9 271 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 FCRL1Q96LA6 429 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ZNF570Q96NI8 536 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 NRTNQ99748 197 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 EHD1Q9H4M9 534 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 EGFL7Q9UHF1 273 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 KCNH1O95259 989 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ERGP11308 486 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PWP1Q13610 501 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PAGE2BQ5JRK9 111 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 IFNEQ86WN2 208 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 KBTBD2Q8IY47 623 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ASB12Q8WXK4 309 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 EGLN2Q96KS0 407 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LRGUKQ96M69 825 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 C12orf66Q96MD2 445 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 OR52E6Q96RD3 313 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CGREF1Q99674 301 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.8■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PIPSLA2A3N6 862 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 POM121BA6NF01 834 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SH3BGRLO75368 114 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 RPSAP08865 295 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GSK3BP49841 420 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CLDN2P57739 230 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 RHDQ02161 417 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LIPEQ05469 1076 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GTF2H4Q92759 462 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CROCCQ5TZA2 2017 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LRATO95237 230 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GABRG2P18507 467 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ATP6V1B2P21281 511 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LRRC36Q1X8D7 754 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LCTLQ6UWM7 567 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 FGF22Q9HCT0 170 aa24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PCSK2P16519 638 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PEX2P28328 305 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 RPS13P62277 151 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TRIP10Q15642 601 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LPCAT4Q643R3 524 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 MENTQ9BUN1 341 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SPNS1Q9H2V7 528 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PPT2Q9UMR5 302 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.78■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SCAMP1O15126 338 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 GRIA3P42263 894 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 MTPNP58546 118 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SYT12Q8IV01 421 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 LAS2Q8IYD9 372 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 HMGB4Q8WW32 186 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TESCQ96BS2 214 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 MSANTD3Q96H12 275 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 HAUS8Q9BT25 410 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 VAPAQ9P0L0 249 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TAC3Q9UHF0 121 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CA5BQ9Y2D0 317 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 CDH1P12830 882 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 HSD17B2P37059 387 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 IZUMO2Q6UXV1 221 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 TRIM69Q86WT6 500 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 FLCNQ8NFG4 579 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms