RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344770.6

PDZK1-201, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PDZK1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-201ENST00000344770 CA3P07451 260 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MYOGP15173 224 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TNNI1P19237 187 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 IMPDH1P20839 514 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CAPGP40121 348 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 NAGLUP54802 743 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TFDP1Q14186 410 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 GAS6Q14393 721 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 RAB39AQ14964 217 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CDK10Q15131 360 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TCTN1Q2MV58 587 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 HKDC1Q2TB90 917 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 NANPQ8TBE9 248 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TOP1MTQ969P6 601 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 LURAP1Q96LR2 239 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 DUSP26Q9BV47 211 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 UBE4BO95155 1302 aa9.57□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 APOL3O95236 402 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CPNE6O95741 557 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CDH1P12830 882 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 INSRRP14616 1297 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TCF4P15884 667 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CD247P20963 164 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MYF6P23409 242 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 THBS2P35442 1172 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 LIG4P49917 911 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MEOX2P50222 304 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 AQP5P55064 265 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 GNA12Q03113 381 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PTP4A2Q12974 167 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 GPR176Q14439 515 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PON3Q15166 354 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 UBXN11Q5T124 520 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 GPR107Q5VW38 600 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 ANKS6Q68DC2 871 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CDC73Q6P1J9 531 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 METTL23Q86XA0 190 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PARP8Q8N3A8 854 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 LRFN1Q9P244 771 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 A0A0B4J293 547 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 A6NL46 340 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MEI4A8MW99 385 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 NDUFS2O75306 463 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 RFPL2O75678 378 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 OAZ2O95190 189 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 HNF1AP20823 631 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 NT5EP21589 574 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PROZP22891 400 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 CTSSP25774 331 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 KLRC2P26717 231 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 MARCKSL1P49006 195 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 PGDP52209 483 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 DEFB103AP81534 67 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 NPRL3Q12980 569 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 SLAQ13239 276 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 SMCO1Q147U7 214 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 POU4F3Q15319 338 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZK1-201ENST00000344770 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms