RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF676Q8N7Q3 588 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 UPB1Q9UBR1 384 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC36Q8IYA8 594 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 C7orf57Q8NEG2 295 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 NPIPA5E9PKD4 350 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 TLR4O00206 839 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.79■■□□□ 1.08
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