RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TMEM74Q96NL1 305 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ACTR8Q9H981 624 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 H7BY64 318 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SERPINE1P05121 402 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CXCR2P25025 360 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GRIA3P42263 894 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 LCP2Q13094 533 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.854e-7■■■□□ 14.6
YBX1-201ENST00000321358 ATG16L1Q676U5 607 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 DHRS13Q6UX07 377 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KMT5CQ86Y97 462 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 DRC3Q9H069 523 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PELI2Q9HAT8 420 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PDP2Q9P2J9 529 aa20.35■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 E7EQ34 232 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NPHS1O60500 1241 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KCNK5O95279 499 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MAGP20916 626 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CHIT1Q13231 466 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 STX3Q13277 289 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ATG9BQ674R7 924 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TCTN2Q96GX1 697 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PPM1MQ96MI6 270 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 EHD1Q9H4M9 534 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PDE7BQ9NP56 450 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ACSS2Q9NR19 701 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.34■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PVRP15151 417 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ST6GAL1P15907 406 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 BGNP21810 368 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SEPHS1P49903 392 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 INHBCP55103 352 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 HSD11B2P80365 405 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 LAPTM5Q13571 262 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TBCCQ15814 346 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KRT78Q8N1N4 520 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 STRADBQ9C0K7 418 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.33■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.33■□□□□ 0.84
YBX1-201ENST00000321358 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.32■□□□□ 0.84
YBX1-201ENST00000321358 TMEM114B3SHH9 223 aa20.32■□□□□ 0.84
YBX1-201ENST00000321358 UGDHO60701 494 aa20.32■□□□□ 0.84
YBX1-201ENST00000321358 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
YBX1-201ENST00000321358 CLDN9O95484 217 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms