RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 EXD2Q9NVH0 621 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ALOX12P18054 663 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DCTP40126 519 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RGRP47804 291 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MPP7Q5T2T1 576 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CPZQ66K79 652 aa8.6□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CORO1BQ9BR76 489 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 LHPPQ9H008 270 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IFNW1P05000 195 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ARSAP15289 507 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HSD17B2P37059 387 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ARF5P84085 180 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 VEZF1Q14119 521 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FGD3Q5JSP0 725 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF691Q5VV52 312 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 XKR5Q6UX68 686 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CPXM2Q8N436 756 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FBXL8Q96CD0 374 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 VAPAQ9P0L0 249 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PITPNM1O00562 1244 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PCDH7O60245 1069 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CPNE6O95741 557 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CD36P16671 472 aa8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 KDELR2P33947 212 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GPR1P46091 355 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ITGA1P56199 1179 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NKX3-2P78367 333 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 C2orf80Q0P641 193 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SCARB2Q14108 478 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ADCK2Q7Z695 626 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SPARTQ8N0X7 666 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 POC5Q8NA72 575 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FIBINQ8TAL6 211 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF583Q96ND8 569 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MMP27Q9H306 513 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RASSF1Q9NS23 344 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ISPDA4D126 451 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 ATF6P18850 670 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CTSKP43235 329 aa8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MUL1Q969V5 352 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 COL21A1Q96P44 957 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TCF25Q9BQ70 676 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 BRF2Q9HAW0 419 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NBNO60934 754 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SEC14L2O76054 403 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRNPP04156 253 aa8.58□□□□□ -1.04
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