RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ADPRHP54922 357 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 E2F2Q14209 437 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PROSER1Q86XN7 944 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 FCRL1Q96LA6 429 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PLAGL1Q9UM63 463 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SCML1Q9UN30 329 aa23.14■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PQF6 199 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 NCK1P16333 377 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 DRD1P21728 446 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SELPLGQ14242 412 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM259Q4ZIN3 620 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TBCELQ5QJ74 424 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ANO7Q6IWH7 933 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR180Q86V85 440 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 EME1Q96AY2 570 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ITCHQ96J02 903 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 EGLN2Q96KS0 407 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 EHD1Q9H4M9 534 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ACSL5Q9ULC5 683 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 F5P12259 2224 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 AKAP10O43572 662 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 GMNNO75496 209 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 COL9A1P20849 921 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP51A1Q16850 503 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 HORMAD1Q86X24 394 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5K2Q8NHB8 316 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC26Q8NHZ8 85 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR34Q96EX3 536 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 IL17FQ96PD4 163 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 BATF3Q9NR55 127 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.13■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PRMT3O60678 531 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SH3BGRLO75368 114 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ERN1O75460 977 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 GPIP06744 558 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ACP5P13686 325 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CLCNKAP51800 687 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP4F3Q08477 520 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 LAPTM5Q13571 262 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 DPY19L1Q2PZI1 675 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SPIN4Q56A73 249 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ADNP2Q6IQ32 1131 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 NXPE4Q6UWF7 544 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM131CQ96AQ9 280 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNH6Q9H252 994 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PREBQ9HCU5 417 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CD207Q9UJ71 328 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PPT2Q9UMR5 302 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PIPSLA2A3N6 862 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TIPRLO75663 272 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 UQCRBP14927 111 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4D2P58180 307 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS13P62277 151 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 RIMKLAQ8IXN7 391 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 BTBD9Q96Q07 612 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 HAUS8Q9BT25 410 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 MOSPD1Q9UJG1 213 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 USP22Q9UPT9 525 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 AP3M1Q9Y2T2 418 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 PCM1Q15154 2024 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 ACADMP11310 421 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 KIR3DL1P43629 444 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 STARD8Q92502 1023 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 RMI1Q9H9A7 625 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A096LPI6 279 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD1-201ENST00000007264 TXNDC9O14530 226 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms