RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bop1P97452 732 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PtprnQ60673 979 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fzd4Q61088 537 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prickle2Q80Y24 845 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pdia5Q921X9 517 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NtsQ9D3P9 169 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp2w1E9Q816 493 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DxoO70348 397 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clcn7O70496 803 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Yap1P46938 488 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mup20Q5FW60 181 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klra2Q60660 288 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fbxl4Q8BH70 621 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Elp6Q8BK75 266 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ugt2b34Q8K154 532 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cant1Q8VCF1 403 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fbxl20Q9CZV8 436 aa16.49■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pdia2D3Z6P0 527 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmc3ipO35047 217 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klf10O89091 479 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lire1P11260 357 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 F9P16294 471 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fbxo40P62932 710 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kcna7Q17ST2 489 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pydc3Q3V3Q4 588 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bdkrb1Q61125 334 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Erich5Q8K0S2 362 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr382Q8VF79 312 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcdhga6Q91XY2 932 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sec13Q9D1M0 322 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tcea2Q9QVN7 299 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf11Q9QYK7 154 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd160O88875 185 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TshrP47750 764 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Alox5P48999 674 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hcrtr1P58307 416 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syndig1lQ3USQ7 237 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Il18r1Q61098 537 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Galnt13Q8CF93 556 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cops8Q8VBV7 209 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptbp2Q91Z31 531 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gstt3Q99L20 241 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spesp1Q9D5A0 399 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Capns2Q9D7J7 247 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ebna1bp2Q9D903 306 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cldn7Q9Z261 211 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1145A2AVC7 325 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm8871F7AXK2 190 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TpmtO55060 240 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hcn3O88705 779 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tuba4aP68368 448 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1128Q7TR47 311 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clec2eQ80XD9 204 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sema3dQ8BH34 777 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Glt28d2Q8BML3 165 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lurap1lQ8K2P1 221 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MlycdQ99J39 492 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kcna10B2RQA1 511 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5799E9Q2M1 201 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H2-Q7P14429 334 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H2-Q9P14431 200 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 F2P19221 618 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tas2r104Q7M723 302 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Amigo1Q80ZD8 492 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gramd1cQ8CI52 457 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptgr1Q91YR9 329 aa16.48■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Auts2A0A087WPF7 1261 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r88L7N1W8 857 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sult3a1O35403 293 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syt4P40749 425 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Defb23Q30KP0 166 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tatdn1Q6P8M1 295 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tigd3Q7TM95 470 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klhl3E0CZ16 587 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fabp1P12710 127 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ift52Q62559 426 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcdha8Q91Y12 946 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 LsrQ99KG5 594 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pex6Q99LC9 981 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Unc50Q9CQ61 259 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Uba7Q9DBK7 977 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NinQ61043 2035 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp651E9PZ11 729 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm11236J3QMS7 360 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm6614M0QWR8 670 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rgs7O54829 469 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gstm1P10649 218 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atp1b2P14231 290 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bmp4P21275 408 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.6 ms