RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1600015I10RikE9Q745 711 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PdynO35417 248 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyp2a4P15392 494 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyp2a5P20852 494 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rad51Q08297 339 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q14AM7 275 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tstd2Q3U269 495 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PrlhrQ6VMN6 370 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Stk38lQ7TSE6 464 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PeloQ80X73 385 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rtp2Q80ZI2 223 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cxcr1Q810W6 351 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Myoz3Q8R4E4 245 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr48Q8VGN4 301 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fitm1Q91V79 292 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fam136aQ9CR98 138 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4930513O06RikQ9D549 161 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc25a27Q9D6D0 322 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pnp2Q9D8C9 305 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olig2Q9EQW6 323 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tgm1Q9JLF6 815 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ap1m2Q9WVP1 423 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Speer3W4VSP1 261 aa14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ssxb8B1AY40 170 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zbed6D2EAC2 980 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 BC051665E9Q623 330 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r12L7N217 831 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Angpt1O08538 498 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Bmp6P20722 510 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FerP70451 823 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Msx2Q03358 267 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CtrcQ3SYP2 268 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dtx3lQ3UIR3 748 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Axdnd1Q3UZ57 424 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tlr12Q6QNU9 906 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 OsgepQ8BWU5 335 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Casp9Q8C3Q9 454 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Piwil4Q8CGT6 848 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Scara5Q8K299 491 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc29a4Q8R139 528 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Adap2Q8R2V5 381 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sorcs3Q8VI51 1219 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dio3Q91ZI8 304 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 NpvfQ9ESQ8 188 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sphk2Q9JIA7 617 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Socs6Q9JLY0 533 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zbp1Q9QY24 411 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 RpgrQ9R0X5 1001 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Spry4Q9WTP2 300 aa14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Unc13cQ8K0T7 2210 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 A0A286YDP4 300 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tcp11x2A2AEI7 503 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Chst13D3Z6E3 336 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp946F6VWU8 523 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp607bG3X9H3 648 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r44L7N2E1 861 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpr27O54897 379 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Psmb5O55234 264 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ntrk2P15209 821 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Akr1b7P21300 316 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pxmp2P42925 194 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tnfsf4P43488 198 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm8773Q3UQ24 132 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pcdhga7Q6DD96 935 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sohlh1Q6IUP1 357 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dclre1cQ8K4J0 705 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cadm4Q8R464 388 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr659Q8VGV6 322 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vnn3Q9QZ25 500 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc22a4Q9Z306 553 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc175E9PVB3 822 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il1rl1P14719 567 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 GckP52792 465 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PctpP53808 214 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tsc22d1P62500 1077 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cpt1aP97742 773 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 B3gnt4Q1RLK6 350 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nol9Q3TZX8 714 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nr6a1Q64249 495 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tas2r39Q7TQA5 319 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ZfatQ7TS63 1237 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Krcc1Q99JT5 256 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mdm1Q9D067 708 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hacd2Q9D3B1 254 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cep83Q9D5R3 692 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc28a3Q9ERH8 703 aa14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dnase2bQ9QY48 354 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms