RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cct7P80313 544 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zscan26Q5RJ54 466 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shkbp1Q6P7W2 704 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif18bQ6PFD6 834 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atl1Q8BH66 558 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4922Q8C0N0 497 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1310Q8VF85 312 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc39a5Q9D856 535 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HephQ9Z0Z4 1157 aa15.65■□□□□ 0.1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r114E9Q281 856 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinb9eO08806 377 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PahP16331 453 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapkapk2P49138 386 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn2Q06180 406 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med22Q62276 200 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hist2h2acQ64523 129 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CroccQ8CJ40 2009 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glis1Q8K1M4 789 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf2h3Q8VD76 309 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sacm1lQ9EP69 587 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ScelQ9EQG3 652 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A0A286YD17 136 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13089A2AGW7 455 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5415E9PXF3 478 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox2hK7N6P1 191 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm2888K7N746 267 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 JundP15066 341 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bmp6P20722 510 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd247P24161 164 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh1a1P24549 501 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arf5P84084 180 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emx2Q04744 253 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itgb8Q0VBD0 767 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sel1l2Q3V172 688 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tusc1Q673H1 205 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smad3Q8BUN5 425 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oas1gQ8K469 367 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SarafQ8R3Q0 334 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr729Q8VET4 323 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufs2Q91WD5 463 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gemin6Q9CX53 166 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D4W2 315 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgf22Q9ESS2 162 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MaffO54791 156 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cxcr3O88410 367 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CkbQ04447 381 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NapepldQ8BH82 396 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf219Q8K2Y0 722 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GabrpQ8QZW7 440 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Blzf1Q8R2X8 403 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbms2Q8VC70 383 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtfr2Q8VED8 361 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr441Q8VFS5 310 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fads1Q920L1 447 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TrabdQ99JY4 376 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plpp3Q99JY8 312 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnase10Q9D5A9 208 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl46Q9EQI8 283 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PalmdQ9JHU2 551 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cog8Q9JJA2 640 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpini2Q9JK88 405 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hacl1Q9QXE0 581 aa15.64■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plxna1P70206 1894 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp973A2BE20 318 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Catsperg2C6KI89 1145 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17615E9Q9P2 165 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm340F6RGI3 1242 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arfip1G5E8V9 373 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rgs4O08899 205 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npc1O35604 1277 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elovl3O35949 271 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp28P10078 825 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lire1P11260 357 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cma1P21844 247 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acvr1P37172 509 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FhP97807 507 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam47cQ14BE7 430 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acsm3Q3UNX5 580 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bhlha9Q5RJB0 231 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr37Q8CBE3 496 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5591Q8CDK1 855 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TesclQ9DAJ7 231 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5478D3Z6R0 159 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8897L7N294 181 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh3P10287 822 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stat6P52633 837 aa15.63■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neurog1P70660 244 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms