RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PPV9	198 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549		E7ENX8	843 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ABHD2	P08910	425 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	HBQ1	P09105	142 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	FAM87A	P0C7U9	286 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	HRH2	P25021	359 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	IMPA1	P29218	277 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CMPK1	P30085	196 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	RAB10	P61026	200 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TAP2	Q03519	686 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	STARD8	Q92502	1023 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	DLG3	Q92796	817 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	LHX9	Q9NQ69	397 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	KATNA1	O75449	491 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SCRG1	O75711	98 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TCN2	P20062	427 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	MAG	P20916	626 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SAT1	P21673	171 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CNTF	P26441	200 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CRABP2	P29373	138 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	GRIA3	P42263	894 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	GABRA4	P48169	554 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ITGA1	P56199	1179 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ZIC1	Q15915	447 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SBSN	Q6UWP8	590 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CEP97	Q8IW35	865 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	OR1L3	Q8NH93	324 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-231	ENST00000557549	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	OR2A25	A4D2G3	310 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	KRT87P	A6NCN2	255 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549		E7EQ34	232 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	HCRTR1	O43613	425 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	PIAS1	O75925	651 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	ACSL3	O95573	720 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	FURIN	P09958	794 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	HNMT	P50135	292 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	SERPINB9	P50453	376 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	CDC20	Q12834	499 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	GPS2	Q13227	327 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	PHKG1	Q16816	387 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-231	ENST00000557549	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		11.83	□□□□□ -0.52

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