RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 B4DGG1 531 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 HTR6P50406 440 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SGO1Q5FBB7 561 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ATG9BQ674R7 924 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SFRP1Q8N474 314 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 OR4E2Q8NGC2 313 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC37A2Q8TED4 501 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SELENOMQ8WWX9 145 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PATE1Q8WXA2 126 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PIGKQ92643 395 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 NELL1Q92832 810 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 EFCAB11Q9BUY7 163 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SRMSQ9H3Y6 488 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SAR1AQ9NR31 198 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC28A1O00337 649 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 XKR7Q5GH72 579 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 NXPE4Q6UWF7 544 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 RNF165Q6ZSG1 346 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM74BQ9NUR3 256 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ARMCX1Q9P291 453 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa26.74■■□□□ 1.87
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GNPTAB-206ENST00000549940 YY2O15391 372 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 RGS14O43566 566 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 UBOX5O94941 541 aa26.73■■□□□ 1.87
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GNPTAB-206ENST00000549940 LAPTM5Q13571 262 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 IMPG1Q17R60 797 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF19Q2TAC6 998 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CATSPEREQ5SY80 951 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 FRG2Q64ET8 278 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SYT12Q8IV01 421 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 AVL9Q8NBF6 648 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 USP7Q93009 1102 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 REPS1Q96D71 796 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 FRG2BQ96QU4 278 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 HBEGFQ99075 208 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 MRGBPQ9NV56 204 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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GNPTAB-206ENST00000549940 ANXA6P08133 673 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SP9P0CG40 484 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 LBPP18428 481 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CD22P20273 847 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CTSKP43235 329 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 GPR18Q14330 331 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM198Q66K66 360 aa26.73■■□□□ 1.87
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GNPTAB-206ENST00000549940 WDR34Q96EX3 536 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CATSPER2Q96P56 530 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SH2B3Q9UQQ2 575 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 LMO7DNF2Z398 122 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 H0YIV9 168 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PEX11AO75192 247 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PIAS2O75928 621 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CDH1P12830 882 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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GNPTAB-206ENST00000549940 MED27Q6P2C8 311 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 TRIM46Q7Z4K8 759 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SDC3O75056 442 aa26.71■■□□□ 1.87
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GNPTAB-206ENST00000549940 PSMB5P28074 263 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 DPP6P42658 865 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 HHEXQ03014 270 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF33BQ06732 778 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 NR6A1Q15406 480 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM91A1Q658Y4 838 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 ICE2Q659A1 982 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 UBE2E3Q969T4 207 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC22A18Q96BI1 424 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PELI2Q9HAT8 420 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PCM1Q15154 2024 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CCNDBP1O95273 360 aa26.7■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 CXCR2P25025 360 aa26.7■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 BIRC2Q13490 618 aa26.7■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 GALNTL6Q49A17 601 aa26.7■■□□□ 1.87
GNPTAB-206ENST00000549940 Q6ZSR9 355 aa26.7■■□□□ 1.87
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