RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CUL1Q13616 776 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR8K5Q8NH50 307 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CALML6Q8TD86 181 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFAP36Q96G28 342 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNF8Q96H20 258 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FANCEQ9HB96 536 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LATS2Q9NRM7 1088 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC17A6Q9P2U8 582 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNX24Q9Y343 169 aa18.5■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0J9YY10 115 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 RASGRF2O14827 1237 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TP73O15350 636 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 C2orf54Q08AI8 447 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPS2Q13227 327 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIR2DS3Q14952 304 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTC23LQ6PF05 361 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGFL3Q6UXB1 125 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDIK1LQ8N165 341 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOPNLQ96NB1 174 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRFN5Q96NI6 719 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 NLNQ9BYT8 704 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCFL5Q9UL49 500 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC16AO15027 2179 aa18.49■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRTM2O43300 516 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP3K7O43318 606 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 MATN4O95460 622 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTSBP07858 339 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 DENND1AQ8TEH3 1009 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TM9SF4Q92544 642 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDNQ99608 321 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR21Q99679 349 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHST8Q9H2A9 424 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FER1L5A0AVI2 2057 aa18.48■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC88CQ9P219 2028 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTC4O95801 387 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAGP20916 626 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSMB5P28074 263 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 GABRB3P28472 473 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP5DP30049 168 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 GABRA4P48169 554 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 HIF1AQ16665 826 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRB2Q5IJ48 1285 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCN10Q6JVE6 187 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CERS2Q96G23 380 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 NAT9Q9BTE0 207 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 DPH5Q9H2P9 285 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 HIVEP1P15822 2718 aa18.47■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRSS44E7EML9 344 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAD51CO43502 376 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 MSL3P1P0C860 447 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP2A7P20853 494 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCNFP41002 786 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARL4CP56559 192 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD200R1Q8TD46 325 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNJ9Q92806 393 aa18.46■□□□□ 0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLIP3Q96DZ5 547 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms