RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 H0YIV9 168 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 PDYNP01213 254 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 SLC2A4P14672 509 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 SLC19A1P41440 591 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 C17orf64Q86WR6 236 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 A0A0G2JNG1 304 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 NEK2P51955 445 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 FANCMQ8IYD8 2048 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 COX4I1P13073 169 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 PMS2CLQ68D20 193 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 OR7G3Q8NG95 312 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 KLHL29Q96CT2 875 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-209ENST00000529757 PELI2Q9HAT8 420 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 POT1Q9NUX5 634 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 AIG1Q9NVV5 245 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 SPASTQ9UBP0 616 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 PIPSLA2A3N6 862 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 THRAP10827 490 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-209ENST00000529757 PCNAP12004 261 aa16.02■□□□□ 0.16
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