RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 LHPPQ9H008 270 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 GALPQ9UBC7 116 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.16■□□□□ 0.18
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HERC3-211ENST00000513325 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.15■□□□□ 0.18
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HERC3-211ENST00000513325 GBX1Q14549 363 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.15■□□□□ 0.18
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HERC3-211ENST00000513325 OR2A25A4D2G3 310 aa16.14■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.14■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MAIP1Q8WWC4 291 aa16.14■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MIEF2Q96C03 454 aa16.14■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 C10orf90Q96M02 699 aa16.14■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 TCF12Q99081 682 aa16.14■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.13■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 LINC00696Q6ZRV3 163 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.13■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 GRHL3Q8TE85 626 aa16.13■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 C8orf44Q96CB5 159 aa16.13■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 C3orf18Q9UK00 162 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 E5RI56 91 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MYO1CO00159 1063 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MAP2K7O14733 419 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CEP104O60308 925 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 HPP00738 406 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
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