RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 LGI4Q8N135 537 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 RNFT2Q96EX2 444 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF607Q96SK3 696 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TUBA1CQ9BQE3 449 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 KCNH6Q9H252 994 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 OARD1Q9Y530 152 aa12.91□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 GADD45GO95257 159 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 PGFP49763 221 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 SMIM11AP58511 58 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 NOGQ13253 232 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 PLEKHG6Q3KR16 790 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 CARD16Q5EG05 197 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ATG9BQ674R7 924 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TPGS2Q68CL5 300 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 NEK5Q6P3R8 708 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM207Q6UWW9 146 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 MCMBPQ9BTE3 642 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 GULP1Q9UBP9 304 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 PHF24Q9UPV7 400 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 M0QX08 132 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 PCSK6P29122 969 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 DMPKQ09013 629 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 DNASE1L3Q13609 305 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 NOXRED1Q6NXP6 359 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 RNF111Q6ZNA4 994 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 PROKR1Q8TCW9 393 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 FRS2Q8WU20 508 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 GAB3Q8WWW8 586 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 SLC39A13Q96H72 371 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 FUNDC2Q9BWH2 189 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ATP6V1HQ9UI12 483 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TAF4O00268 1085 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 PDE9AO76083 593 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 NR2F6P10588 404 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 IMPDH2P12268 514 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 CD1EP15812 388 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 IFNGR2P38484 337 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 CD47Q08722 323 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 SLC36A3Q495N2 470 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF366Q8N895 744 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 KLHDC9Q8NEP7 349 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 SCAMP4Q969E2 229 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 CMTM7Q96FZ5 175 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 MYOCQ99972 504 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 SEMA3GQ9NS98 782 aa12.9□□□□□ -0.34
SPCS3-201ENST00000503362 A0A1B0GTW7 788 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 INMTO95050 263 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CCNB2O95067 398 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 INHAP05111 366 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PCSK2P16519 638 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC6A4P31645 630 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PHF21AQ96BD5 680 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 LHPPQ9H008 270 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TM9SF3Q9HD45 589 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TMED5Q9Y3A6 229 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SHROOM3Q8TF72 1996 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SAGE2PA6NJ88 616 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TSC22D2O75157 780 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CCNKO75909 580 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 C8AP07357 584 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ANXA8P13928 327 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PPM1AP35813 382 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 STK19P49842 368 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MXD1Q05195 221 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HSPB3Q12988 150 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PTPRRQ15256 657 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SH3RF2Q8TEC5 729 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 IL17CQ9P0M4 197 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DRGXA6NNA5 263 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MITFO75030 526 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms