RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PRPS2P11908 318 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A4P14672 509 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UQCRBP14927 111 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NPPBP16860 134 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AMD1P17707 334 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PSMC3P17980 439 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 OXTRP30559 389 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HNF4AP41235 474 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF4P43489 277 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BDKRB1P46663 353 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NEK2P51955 445 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TAP2Q03519 686 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DMPKQ09013 629 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RPA4Q13156 261 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CHIT1Q13231 466 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RPS6KA2Q15349 733 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TRIP10Q15642 601 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CST6Q15828 149 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UGT8Q16880 541 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MMEL1Q495T6 779 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PYCR3Q53H96 274 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PNCKQ6P2M8 343 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PDZD3Q86UT5 571 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM74Q86UV6 250 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DHFR2Q86XF0 187 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LAS2Q8IYD9 372 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf111Q8N326 155 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LIX1Q8N485 282 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PAF1Q8N7H5 531 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPER1Q8NEC5 780 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ATL1Q8WXF7 558 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SUSD6Q92537 303 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM159Q96B96 161 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 APIPQ96GX9 242 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R16AQ96I34 528 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KXD1Q9BQD3 176 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 OR2AG1Q9H205 316 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ALG2Q9H553 416 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ACTR8Q9H981 624 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BRF2Q9HAW0 419 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 VAPAQ9P0L0 249 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SNX6Q9UNH7 406 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AP4S1Q9Y587 144 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPV9 198 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQF6 199 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS12A0PJE2 317 aa5.46□□□□□ -1.54
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