RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CMPK1P30085 196 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 CHAF1BQ13112 559 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SLC9A5Q14940 896 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 RNF44Q7L0R7 432 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 DLG3Q92796 817 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1B0GX78 115 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 FITM1A5D6W6 292 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ARGFXA6NJG6 315 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 E7ENX8 843 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB14O43829 449 aa22.67■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 NR1D1P20393 614 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 ARSFP54793 590 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TAP2Q03519 686 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ING2Q9H160 280 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 CUTCQ9NTM9 273 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TAC3Q9UHF0 121 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SNX24Q9Y343 169 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF839A8K0R7 811 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ALAS2P22557 587 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 GRM7Q14831 915 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 NAA25Q14CX7 972 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 PAQR3Q6TCH7 311 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0J9YVX5 310 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 E7ESA3 106 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 DSCR3O14972 297 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 ATP1A4Q13733 1029 aa22.65■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXB3-202ENST00000460160 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.65■■□□□ 1.22
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HOXB3-202ENST00000460160 ONECUT2O95948 504 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 CASQ1P31415 396 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 CBLBQ13191 982 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF425Q6IV72 752 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 MRGPREQ86SM8 312 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 RAB43Q86YS6 212 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM4Q9C037 500 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 ACSS2Q9NR19 701 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 PDE10AQ9Y233 779 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 FAM187AA6NFU0 413 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 RAD51CO43502 376 aa22.63■■□□□ 1.21
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