RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459174.1

SNORD4A-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 4A, humanhuman

BASIC

Gene SNORD4A, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD4A-201ENST00000459174 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 IRX4P78413 519 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ECT2LQ008S8 904 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 GALK2Q01415 458 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 NAAAQ02083 359 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ACY1Q03154 408 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ZNF85Q03923 595 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CD164Q04900 197 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TGM3Q08188 693 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DMPKQ09013 629 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ZNF763Q0D2J5 394 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 KLHL30Q0D2K2 578 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CDC20Q12834 499 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 MERTKQ12866 999 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 GRIK3Q13003 919 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PPIL2Q13356 520 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 MFAP5Q13361 173 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 C1orf61Q13536 156 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CDH18Q13634 790 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ACVR2BQ13705 512 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 FAM53BQ14153 422 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 GIT2Q14161 759 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DOC2AQ14183 400 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 GALEQ14376 348 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 GGTLC2Q14390 218 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 KRT32Q14532 448 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 GRM4Q14833 912 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TMEM132DQ14C87 1099 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CLCA4Q14CN2 919 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TNIP1Q15025 636 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 HERC3Q15034 1050 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TAF5Q15542 800 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 SLC9A3R2Q15599 337 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CNGA2Q16280 664 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 NTRK2Q16620 822 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CDKN3Q16667 212 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DECR1Q16698 335 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ATP2B3Q16720 1220 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 LONRF1Q17RB8 773 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DUOXA1Q1HG43 343 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ALG11Q2TAA5 492 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CCDC57Q2TAC2 916 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 AP5B1Q2VPB7 878 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DEFB116Q30KQ4 102 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ANO4Q32M45 955 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 RFX4Q33E94 735 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 MS4A18Q3C1V0 323 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TKFCQ3LXA3 575 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 POM121L1PQ3SYA9 428 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 C5orf22Q49AR2 442 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 AMOTQ4VCS5 1084 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TMEM35AQ53FP2 167 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 COBLL1Q53SF7 1204 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ZNF789Q5FWF6 425 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 C3orf38Q5JPI3 329 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 FBXO47Q5MNV8 452 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 SLC10A5Q5PT55 438 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 SH2D4BQ5SQS7 431 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TEX35Q5T0J7 233 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 FAM182AQ5T1J6 154 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TMEM63BQ5T3F8 832 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 WLSQ5T9L3 541 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CCDC181Q5TID7 509 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 AGAP6Q5VW22 663 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 TMEM268Q5VZI3 342 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 RRAGBQ5VZM2 374 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ALS2CLQ60I27 953 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 OLFML2AQ68BL7 652 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ACSM2BQ68CK6 577 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DENND2CQ68D51 928 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 NCR3LG1Q68D85 454 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 LIN54Q6MZP7 749 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CES5AQ6NT32 575 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 ERAP2Q6P179 960 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 SLC27A4Q6P1M0 643 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 WDR93Q6P2C0 686 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 PLBD1Q6P4A8 553 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 FAM122CQ6P4D5 195 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 CORO6Q6QEF8 472 aa-0.25□□□□□ -2.45
SNORD4A-201ENST00000459174 KLHL24Q6TFL4 600 aa-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms