RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 NXPH1P58417 271 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LONP2Q86WA8 852 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LMX1AQ8TE12 382 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPN14A8MX76 684 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 B4DGG1 531 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ULK1O75385 1050 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CHEK2O96017 543 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 BNIP1Q12981 228 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2A13Q16696 494 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 XKR7Q5GH72 579 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MIEF2Q96C03 454 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 C9JVG2 144 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC22O60826 627 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT34O76011 436 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 GNAZP19086 355 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB28P51157 221 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DIO3P55073 304 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 NUDT8Q8WV74 236 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 NELL1Q92832 810 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR18Q14330 331 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LPAL2Q16609 132 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PMS2CLQ68D20 193 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXO27Q8NI29 283 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MIPEPQ99797 713 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CCL27Q9Y4X3 112 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 UBDO15205 165 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PKLRP30613 574 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 BNC1Q01954 994 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PLK5Q496M5 336 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 IQCHQ86VS3 1027 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 GAB3Q8WWW8 586 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LCN9Q8WX39 176 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DYRK1BQ9Y463 629 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 H7BY64 318 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 YY2O15391 372 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 JUPP14923 745 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 BLKP51451 505 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 BNIP3Q12983 259 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF19Q2TAC6 998 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PLD3Q8IV08 490 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ACPTQ9BZG2 426 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ELOVL6Q9H5J4 265 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 BTN3A3O00478 584 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 VILLO15195 856 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 C21orf59P57076 290 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 NR6A1Q15406 480 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 SMPDL3AQ92484 453 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 USP7Q93009 1102 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-204ENST00000452765 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms