RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9J4A7 227 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BMM5 538 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL41O60662 606 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 NIPSNAP2O75323 286 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEACAM4O75871 244 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 F7P08709 466 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH3P22223 829 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FMO4P31512 558 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELK3P41970 407 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PER3P56645 1201 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAV1Q03135 178 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPA14Q0VDF9 509 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTBP1Q13363 440 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRB7Q14451 532 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIF1AQ16665 826 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 BBS9Q3SYG4 887 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYTL3Q4VX76 610 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEP128Q6ZU80 1094 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNMB4Q86W47 210 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 TICAM1Q8IUC6 712 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDIK1LQ8N165 341 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 D2HGDHQ8N465 521 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC1AQ8NC01 280 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 C19orf60Q96EN9 201 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCTN2Q96GX1 697 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 HGH1Q9BTY7 390 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 NLNQ9BYT8 704 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASF1BQ9NVP2 202 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 WHRNQ9P202 907 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GALPQ9UBC7 116 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO5Q9UKT4 447 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 POMT2Q9UKY4 750 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ICKQ9UPZ9 632 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASF1AQ9Y294 204 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.45□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR6C74A6NCV1 312 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 MEN1O00255 615 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 BTN3A3O00478 584 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 BTN3A1O00481 513 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP2K7O14733 419 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 KPNA5O15131 536 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PFDN6O15212 129 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 APOA4P06727 396 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERVK-10P10266 1014 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 AGXTP21549 392 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GABRB3P28472 473 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP5DP30049 168 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 OTX2P32243 289 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLCN7P51798 805 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLTPP55058 493 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ITGA1P56199 1179 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL4CP56559 192 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPP1Q00013 466 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRKG2Q13237 762 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP1A4Q13733 1029 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GALNT7Q86SF2 657 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSELQ8IZU8 1212 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC34A3Q8N130 599 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CARFQ8N187 725 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 GIMAP7Q8NHV1 300 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CALML6Q8TD86 181 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 LCN9Q8WX39 176 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CERS2Q96G23 380 aa10.44□□□□□ -0.74
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