RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ARPC2O15144 300 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 GLRA3O75311 464 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CDK2AP2O75956 126 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CLDN1O95832 211 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 RAB40ALP0C0E4 278 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 DANCRP0C864 163 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 IRF2P14316 349 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MMP12P39900 470 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PTGER3P43115 390 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CCR3P51677 355 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PEX6Q13608 980 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 VEZF1Q14119 521 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 HERC3Q15034 1050 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CA9Q16790 459 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 SPDYCQ5MJ68 293 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 LYSMD4Q5XG99 296 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM207Q6UWW9 146 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 BRINP3Q76B58 766 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 IQCHQ86VS3 1027 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 NDUFAF2Q8N183 169 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 Q8N377 158 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MAPK15Q8TD08 544 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MOB3AQ96BX8 217 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 SPHK2Q9NRA0 654 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa2.75□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM221A6NGB7 291 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MSGN1A6NI15 193 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 KPNA7A9QM74 516 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ADAM20O43506 726 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 DDHD2O94830 711 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 DUX4L4P0CJ87 422 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 HUNKP57058 714 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 GCNT1Q02742 428 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 RALGDSQ12967 914 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 DRP2Q13474 957 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 IL11RAQ14626 422 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PTPRCAPQ14761 206 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TNIP1Q15025 636 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 XKR3Q5GH77 459 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 C9orf152Q5JTZ5 239 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MMD2Q8IY49 270 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 DCLK2Q8N568 766 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TC2NQ8N9U0 490 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 AZIN2Q96A70 460 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM20AQ96MK3 541 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 KRT12Q99456 494 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 NYXQ9GZU5 481 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 Q9N2K0 584 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MYNNQ9NPC7 610 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 OLAHQ9NV23 265 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 RNF150Q9ULK6 438 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CHKBQ9Y259 395 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 R4GN57 208 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PASKQ96RG2 1323 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TRBC2A0A5B9 178 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 KLLNB2CW77 178 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TOMM70O94826 608 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PGM3O95394 542 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CAPN2P17655 700 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 PRKACGP22612 351 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MPZP25189 248 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 OPRL1P41146 370 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 TSFMP43897 325 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 ASCL1P50553 236 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 MYL7Q01449 175 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDMT1-204ENST00000424636 CUL3Q13618 768 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms