RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327443.8

SP1-201, Transcript of Sp1 transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SP1, Length 2,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1-201ENST00000327443 CFHP08603 1231 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ERVK-10P10266 1014 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CKBP12277 381 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PSMB9P28065 219 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CLCN7P51798 805 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 POU4F1Q01851 419 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 FGFBP1Q14512 234 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 MEP1AQ16819 746 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 GPR33Q49SQ1 333 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 KLHL12Q53G59 568 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CLLU1Q5K131 121 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 SSX9Q7RTT3 188 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 STPG2Q8N412 459 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 WNT8BQ93098 351 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 MAP3K3Q99759 626 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 SDCBP2Q9H190 292 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PDE10AQ9Y233 779 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 A0A1W2PP18 115 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 FAM74A7A6NL05 159 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 LGALS8O00214 317 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PTGESO14684 152 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 RFPL1O75677 317 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CSF2P04141 144 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 AGXTP21549 392 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCMT1P22061 227 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 FASP25445 335 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ADRA1BP35368 520 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 THPOP40225 353 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 SPCS3P61009 180 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PRKCDQ05655 676 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ORC1Q13415 861 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 AAK1Q2M2I8 961 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 KLHL26Q53HC5 615 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 RRM2BQ7LG56 351 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CMTM6Q9NX76 183 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PADI3Q9ULW8 664 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TRIP11Q15643 1979 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 MROH6A6NGR9 719 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 VEGFDO43915 354 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 HPGDSO60760 199 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PROSCO94903 275 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PRF1P14222 555 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TCF4P15884 667 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TYMPP19971 482 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PSMA2P25787 234 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 MAP2K4P45985 399 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 SMSP52788 366 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 GPR17Q13304 367 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TFDP2Q14188 446 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 TMEM198Q66K66 360 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.55□□□□□ -0.88
SP1-201ENST00000327443 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms