RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 PLLPQ9Y342 182 aa21.4■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 CACNA1AO00555 2505 aa21.4■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF26BQ2KJY2 2108 aa21.4■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC189A1A4V9 331 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 TYROBPO43914 113 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 KLK8O60259 260 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 PLIN3O60664 434 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 WDR47O94967 919 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 HGFP14210 728 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 GGT5P36269 586 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 CDKL4Q5MAI5 379 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 ICE2Q659A1 982 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 CD180Q99467 661 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 NCOR2Q9Y618 2525 aa21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1-201ENST00000298466 A0A0J9YY10 115 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 STK16O75716 305 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CCKBRP32239 447 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 GRIA3P42263 894 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SH3BP2P78314 561 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CD244Q9BZW8 370 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 MKS1Q9NXB0 559 aa21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 A8MT66 165 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 DLX3O60479 287 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SETDB1Q15047 1291 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 DPH7Q9BTV6 452 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM60AQ9NP50 221 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 PCM1Q15154 2024 aa21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 G3V2L1 256 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SMIM24O75264 130 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 MPP2Q14168 576 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC63Q8NA47 563 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 NEIL2Q969S2 332 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 H7BY64 318 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 HCRTR1O43613 425 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CCND1P24385 295 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC153Q494R4 210 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 TTMPQ5BVD1 217 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FCRL6Q6DN72 434 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 LCTLQ6UWM7 567 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 TLCD1Q96CP7 247 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SH3GL2Q99962 352 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 MED4Q9NPJ6 270 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 KLK13Q9UKR3 277 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 PTPRBP23467 1997 aa21.37■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CCL4P13236 92 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CMPK1P30085 196 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM129CQ86XR2 697 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 STRADBQ9C0K7 418 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 H3BQF6 201 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 CDH1P12830 882 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FOLR1P15328 257 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 EPORP19235 508 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ITIH1P19827 911 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 HSD11B2P80365 405 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 C17orf64Q86WR6 236 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 PCBD2Q9H0N5 130 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 WASF3Q9UPY6 502 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1-201ENST00000298466 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms