RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem236A2ARJ3 344 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rundc3aO08576 446 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rgs4O08899 205 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 NumblO08919 604 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01664 111 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 MyogP12979 224 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 EnpepP16406 945 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eno3P21550 434 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 PgrQ00175 926 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mmp11Q02853 492 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Riiad1Q3KNY5 119 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 DtlQ3TLR7 729 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Glb1l2Q3UPY5 636 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prdm6Q3UZD5 596 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gata6Q61169 589 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mep1bQ61847 704 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 BegainQ68EF6 600 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam124bQ8BLQ0 456 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mab21L3Q8CI17 429 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Erlec1Q8VEH8 483 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 HnmtQ91VF2 295 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krt5Q922U2 580 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nipa2Q9JJC8 359 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm29797A0A140LIA7 188 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm21731A0A286YDE9 180 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Agpat1O35083 285 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ift81O35594 676 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tpst2O88856 376 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Klk1b26P36369 261 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 NxnP97346 435 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcnh6Q32ME0 950 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm4981Q3ULJ8 291 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr384Q7TRX8 312 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gstm7Q80W21 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mospd3Q8BGG6 235 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 RydenQ8CAK3 290 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vmn1r89Q8R256 316 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp940Q8R2Q3 566 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rnf31Q924T7 1066 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trim33Q99PP7 1142 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nudt14Q9D142 222 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Syvn1Q9DBY1 612 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rgs3Q9DC04 966 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cbll1Q9JIY2 491 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cul3Q9JLV5 768 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyhr1Q9QXA1 311 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 ArntlQ9WTL8 632 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 LipgQ9WVG5 500 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm28168A0A087WNP1 180 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm15821A6X8J8 139 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Skint1A7TZE6 364 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm29394H3BIW7 199 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm6351K9J7D1 481 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vmn2r44L7N2E1 861 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Neurod4O09105 330 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01675 107 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01676 107 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01677 107 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01678 107 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Il1rnP25085 178 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gsta3P30115 221 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 NptnP97300 397 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q32M26 199 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ntrk1Q3UFB7 799 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Xlr3aQ60595 226 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Foxs1Q61574 329 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc45a3Q8K0H7 553 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrc25Q8K1T1 297 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 BphlQ8R164 291 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mptx1Q8R1M8 219 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rab28Q99KL7 221 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Psmd8Q9CX56 353 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Moxd1Q9CXI3 613 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plin3Q9DBG5 437 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 CrotQ9DC50 612 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ca7Q9ERQ8 264 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 C1qtnf3Q9ES30 246 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Upk3aQ9JKX8 287 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 H2-BlV9GXR0 257 aa16.26■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lama1P19137 3084 aa16.25■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ttll2A4Q9E4 540 aa16.25■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa16.25■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pot1bH7BX60 640 aa16.25■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Epha8O09127 1004 aa16.25■□□□□ 0.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 IkbkgO88522 412 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms