RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fstl5Q8BFR2 847 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmtc4Q8BG19 741 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bmp3Q8BHE5 468 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata21Q8BHW6 681 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc126Q8BIS8 140 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs7bpQ8BQP9 257 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam221bQ8C627 487 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sept10Q8C650 452 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pnpla8Q8K1N1 776 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scara5Q8K299 491 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HopxQ8R1H0 73 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekhb1Q9QYE9 243 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndrg3Q9QYF9 375 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spint1Q9R097 507 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mroh7A2AVR2 1279 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a54B1AUS6 473 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tex264E9Q137 309 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tex16F6WNY1 1150 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spdye4cI6XKQ3 339 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb9cI7HJI5 387 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ech1O35459 327 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01665 111 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01666 111 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppm1bP36993 390 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alox12P39655 663 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Idh2P54071 452 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Entpd1P55772 510 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sap25Q1EHW4 186 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgef9Q3UTH8 516 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ecm1Q61508 559 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcaf15Q6PFH3 600 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas2r131Q7M708 310 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arl5aQ80ZU0 179 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gemin8Q8BHE1 238 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Palm2Q8BR92 376 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd20Q8CDD8 419 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rftn2Q8CHX7 500 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plac9Q8K262 108 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PolbQ8K409 335 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DeraQ91YP3 318 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mcoln1Q99J21 580 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ift27Q9D0P8 186 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fabp12Q9DAK4 132 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nmnat1Q9EPA7 285 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nif3l1Q9EQ80 376 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ralgps2Q9ERD6 590 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas2r119Q9JKT2 335 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ThadaA8C756 1938 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10717D3Z1I8 228 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r17E9PYF5 849 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TpmtO55060 240 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 IppP28575 584 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a11P31650 627 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MocosQ14CH1 862 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clca4bQ3UW98 925 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Armc5Q5EBP3 926 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rad9bQ6WBX7 403 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vangl1Q80Z96 526 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtsoQ8BM88 312 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hus1Q8BQY8 280 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slitrk6Q8C110 840 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il23rQ8K4B4 644 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem203Q8R235 136 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abhd4Q8VD66 342 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smurf1Q9CUN6 731 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chaf1bQ9D0N7 572 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr711Q9EPG2 314 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nfkb2Q9WTK5 899 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TomtA1Y9I9 258 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nccrp1G3X9C2 266 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mmp10O55123 476 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mpzl2O70255 215 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Brcc3P46737 291 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SykP48025 629 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pou2f2Q00196 463 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ItkQ03526 625 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sdr16c6Q05A13 316 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf800Q0VEE6 662 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rars2Q3U186 578 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acsm3Q3UNX5 580 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pnpla1Q3V1D5 599 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1364Q5SZS9 314 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P4ha2Q60716 537 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ces5aQ6AW46 575 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf503Q7TMA2 652 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Coq4Q8BGB8 266 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ofcc1Q8BGX4 166 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nup107Q8BH74 926 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DrgxQ8BYH0 263 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnot3Q8K0V4 751 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Coq9Q8K1Z0 313 aa9.69□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RbksQ8R1Q9 323 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.8 ms