RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KCNMB4Q86W47 210 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PGBD3Q8N328 593 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FGF13Q92913 245 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PHF21BQ96EK2 531 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA13Q96N96 652 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 32.9
TRPS1-211ENST00000520276 CIPCQ9C0C6 399 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 G3V2T6 193 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CYP7B1O75881 506 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SOX9P48436 509 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CSRP3P50461 194 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IL5RAQ01344 420 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RAPSNQ13702 412 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EFR3AQ14156 821 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TM9SF2Q99805 663 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN4O14817 238 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NCAM2O15394 837 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLITRK5O94991 958 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS23O95084 383 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ANGPTL1O95841 491 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TBX18O95935 607 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TPH1P17752 444 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GRB7Q14451 532 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ACOX1Q15067 660 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RNF135Q8IUD6 432 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KXD1Q9BQD3 176 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FAM92AA1XBS5 289 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NPHS1O60500 1241 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 C1RP00736 705 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PRLP01236 227 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LIPAP38571 399 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DEFA1P59665 94 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DEFA3P59666 94 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LILRA6Q6PI73 481 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TEX37Q96LM6 180 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR2A14Q96R47 310 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ACOX2Q99424 681 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GKN1Q9NS71 199 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FTH1P02794 183 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ATF6P18850 670 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC12A2P55011 1212 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 STARD3Q14849 445 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PON2Q15165 354 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPAT3Q53EU6 434 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP8Q86W28 1048 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A6Q92536 515 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPR22Q99680 433 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NAT9Q9BTE0 207 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CIB4A0PJX0 185 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ASPDHA6ND91 283 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HS6ST1O60243 411 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PGRP06401 933 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CYP4B1P13584 511 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GRK5P34947 590 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC15A1P46059 708 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 B2MP61769 119 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF691Q5VV52 312 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms