RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510173.6

RBM4-208, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3

Gene RBM4, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-208	ENST00000510173	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RAPSN	Q13702	412 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	GRM7	Q14831	915 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SNF8	Q96H20	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SEC16A	O15027	2179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	MMP11	P24347	488 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	AOAH	P28039	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CCNF	P41002	786 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	GPS1	Q13098	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CUL1	Q13616	776 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF534	Q76KX8	674 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TARM1	B6A8C7	271 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SMAP	O00193	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	DSCR3	O14972	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	HCRTR1	O43613	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ONECUT2	O95948	504 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SPTB	P11277	2137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ITGA3	P26006	1051 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	VPS41	P49754	854 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CAV1	Q03135	178 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	WHRN	Q9P202	907 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173		H3BMM5	538 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	NDUFS3	O75489	264 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	UMOD	P07911	640 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	ETS1	P14921	441 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22	1e-11	■■□□□ 12.7
RBM4-208	ENST00000510173	GCGR	P47871	477 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	ARMC3	Q5W041	872 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM4-208	ENST00000510173	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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