RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 GPRC5BQ9NZH0 403 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ERVW-1Q9UQF0 538 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 IL6P05231 212 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 RHOP08100 348 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CAPGP40121 348 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 HALP42357 657 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CREMQ03060 361 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 RELAQ04206 551 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CHRNB3Q05901 458 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 NEDD8Q15843 81 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ZBED5Q49AG3 693 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 TNIP2Q8NFZ5 429 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 THAP11Q96EK4 314 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ABHD8Q96I13 439 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 SERHLQ9NQF3 203 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PKD2L2Q9NZM6 624 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ZNF639Q9UID6 485 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 INVSQ9Y283 1065 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 GFYI3L273 518 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 B4GAT1O43505 415 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PRKD3O94806 890 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 C8GP07360 202 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 SDC1P18827 310 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 MTHFRP42898 656 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PREPP48147 710 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CTSCP53634 463 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CHIT1Q13231 466 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PRR23BQ6ZRT6 265 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 STK32CQ86UX6 486 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 FRS2Q8WU20 508 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 HEPHQ9BQS7 1158 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 BDH2Q9BUT1 245 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CEP44Q9C0F1 390 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 SMURF2Q9HAU4 748 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ITM2BQ9Y287 266 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 A8MU76 341 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 GMNNO75496 209 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 OCM2P0CE71 109 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 RAP2AP10114 183 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CD22P20273 847 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 S100A3P33764 101 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 METAP1P53582 386 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PMS2P3Q13401 168 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CYP2A13Q16696 494 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 FAM162AQ96A26 154 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CXorf21Q9HAI6 301 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 SNX6Q9UNH7 406 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ELOVL7A1L3X0 281 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 FUOMA2VDF0 154 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CXCR6O00574 342 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PORP16435 677 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 VIPR1P32241 457 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CLDN8P56748 225 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 PFN3P60673 137 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 MESP2Q0VG99 397 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 SLC14A1Q13336 389 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ADNP2Q6IQ32 1131 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 C16orf87Q6PH81 154 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 MCOLN3Q8TDD5 553 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 NETO1Q8TDF5 533 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 NCLNQ969V3 563 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC11Q9NVH1 559 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ASIC5Q9NY37 505 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.49□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.48□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN6O43657 245 aa12.48□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 SERPINB7O75635 380 aa12.48□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 EPCAMP16422 314 aa12.48□□□□□ -0.41
PRAME-213ENST00000492657 ARSFP54793 590 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms