RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MATN2O00339 956 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NR2F1P10589 423 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRPS1L1P21108 318 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRDX6P30041 224 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RCN1Q15293 331 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ISCA2Q86U28 154 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DLG3Q92796 817 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 EBPLQ9BY08 206 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 XKR8Q9H6D3 395 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HPS4Q9NQG7 708 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 EXD2Q9NVH0 621 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SCOCQ9UIL1 159 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFS4O43181 175 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDH1P12830 882 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF23P17027 643 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FASP25445 335 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HMGCS1Q01581 520 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GK5Q6ZS86 529 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OR2L2Q8NH16 312 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LYSMD1Q96S90 227 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM38O00635 465 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DUX1O43812 170 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PDE9AO76083 593 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MMP2P08253 660 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 UQCRBP14927 111 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1E1P36543 226 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OPRD1P41143 372 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRLHRP49683 370 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 AGTR2P50052 363 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PHF19Q5T6S3 580 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C12orf40Q86WS4 652 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SEPHS2Q99611 448 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SUFUQ9UMX1 484 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TOR1BO14657 336 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NUAK1O60285 661 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TBPL1P62380 186 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OCA2Q04671 838 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SPRED2Q7Z698 418 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 BDH2Q9BUT1 245 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OR6C74A6NCV1 312 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 AP1G1O43747 822 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TPMTP51580 245 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HHEXQ03014 270 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 WLSQ5T9L3 541 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PDZD3Q86UT5 571 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TPD52L3Q96J77 140 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NDC1Q9BTX1 674 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ARID2Q68CP9 1835 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JNG1 304 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS38A1L453 326 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 H7BY64 318 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINB7O75635 380 aa8.03□□□□□ -1.12
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