RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 TEX12Q9BXU0 123 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 C12orf49Q9H741 205 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 MPP6Q9NZW5 540 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ALG5Q9Y673 324 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP290O15078 2479 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 A8MXK9 166 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF879B4DU55 563 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR182O15218 404 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SOCS5O75159 536 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 XYLBO75191 536 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 IFNGP01579 166 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 BPGMP07738 259 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 THEGLP0DJG4 465 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CD1EP15812 388 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ADORA2AP29274 412 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CRATP43155 626 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PKNOX1P55347 436 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1024LP59773 190 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GPC5P78333 572 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GTF2BQ00403 316 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ALCAMQ13740 583 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 HECTD3Q5T447 861 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM122BQ7Z309 247 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 REC114Q7Z4M0 266 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 BSNDQ8WZ55 320 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SHISA4Q96DD7 197 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM122AQ96E09 287 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 YIPF6Q96EC8 236 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PWWP2AQ96N64 755 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ADA2Q9NZK5 511 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CA14Q9ULX7 337 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 DLGAP1O14490 977 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PROM1O43490 865 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHGA12O60330 932 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP20O60882 483 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PAGE1O75459 146 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 VAPBO95292 243 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ANGPTL1O95841 491 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 LALBAP00709 142 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 C9P02748 559 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFB7P17568 137 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TFEBP19484 476 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 COMTP21964 271 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FPR3P25089 353 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 BMI1P35226 326 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NOS2P35228 1153 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PPM1AP35813 382 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC1A6P48664 564 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MAN2A2P49641 1150 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ACTR1AP61163 376 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TBCELQ5QJ74 424 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 VASNQ6EMK4 673 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR153Q6NV75 609 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 AADACL2Q6P093 401 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NOTUMQ6P988 496 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 VITQ6UXI7 678 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms