RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-202ENST00000466596 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GKN1Q9NS71 199 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AGAP5A6NIR3 686 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AP3D1O14617 1153 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GUCY1B2O75343 617 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRK3P35626 688 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FLT3LGP49771 235 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VLDLRP98155 873 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GPR153Q6NV75 609 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AADATQ8N5Z0 425 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 Q96MT0 163 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TRIB3Q96RU7 358 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SNX6Q9UNH7 406 aa14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GBF1Q92538 1859 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 METTL15A6NJ78 407 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCNKO75909 580 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 JUNDP17535 347 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TACR1P25103 407 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NRIP1P48552 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 M0R082 166 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DSCR3O14972 297 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ADAM12O43184 909 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MFN2O95140 757 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TACR2P21452 398 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CDC20Q12834 499 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 USP43Q70EL4 1123 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OR2T29Q8NH02 315 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 APH1BQ8WW43 257 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OR51E2Q9H255 320 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SP140LQ9H930 580 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ILVBLA1L0T0 632 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CBX4O00257 560 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FFAR2O15552 330 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DYRK3O43781 588 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRAMEF11O60813 436 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ADAMTS4O75173 837 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GLUD1P00367 558 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RFX4Q33E94 735 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DOK6Q6PKX4 331 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SBSNQ6UWP8 590 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NACA2Q9H009 215 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KRT84Q9NSB2 600 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TAPBPO15533 448 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KRT75O95678 551 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRLP01236 227 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RETP07949 1114 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HSMCR30P0CW71 290 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IL18R1Q13478 541 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DENND1CQ8IV53 801 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KCNC2Q96PR1 638 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNF6Q9Y252 685 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 Q9Y3F1 56 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.59□□□□□ -0.07
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FKBP9O95302 570 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BCKDHAP12694 445 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TYMPP19971 482 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TNFRSF1BP20333 461 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRKCZQ05513 592 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms