RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460806.1

BHLHE40-202, Transcript of basic helix-loop-helix family member e40, humanhuman

TSL 2

Gene BHLHE40, Length 396 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40-202ENST00000460806 IRF9Q00978 393 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MC2RQ01718 297 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TAP2Q03519 686 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FOXM1Q08050 763 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CSHL1Q14406 222 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KCNAB1Q14722 419 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZIC1Q15915 447 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 EMBQ6PCB8 327 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CLEC14AQ86T13 490 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 D2HGDHQ8N465 521 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CAVIN3Q969G5 261 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ISL2Q96A47 359 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PTERQ96BW5 349 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR6C1Q96RD1 312 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TAAR9Q96RI9 348 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MIPEPQ99797 713 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CTRCQ99895 268 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CCDC77Q9BR77 488 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 APMAPQ9HDC9 416 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ARL15Q9NXU5 204 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 DKK4Q9UBT3 224 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FETUBQ9UGM5 382 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 RAB21Q9UL25 225 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ACOT9Q9Y305 439 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OARD1Q9Y530 152 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.71□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 USP24Q9UPU5 2620 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KRT37O76014 449 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FKBP9O95302 570 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GUCA1CO95843 209 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FGF5P12034 268 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TFEBP19484 476 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MAGP20916 626 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CMPK1P30085 196 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC5A2P31639 672 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC26A3P40879 764 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GRIA3P42263 894 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GABRA4P48169 554 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 RAB15P59190 212 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TBPL1P62380 186 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CDKL1Q00532 357 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ACY1Q03154 408 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TUBB3Q13509 450 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NAE1Q13564 534 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR4D1Q15615 310 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GPR19Q15760 415 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FCRL6Q6DN72 434 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ISCA2Q86U28 154 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR2L3Q8NG85 312 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR56A3Q8NH54 315 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ATL1Q8WXF7 558 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KIAA1191Q96A73 305 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FBXL8Q96CD0 374 aa6.7□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NXNL1Q96CM4 212 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms