RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 KCNJ1P48048 391 aa8.06□□□□□ -1.12
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ANKRD55-202ENST00000434982 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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ANKRD55-202ENST00000434982 ACVR1Q04771 509 aa8.04□□□□□ -1.12
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ANKRD55-202ENST00000434982 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD55-202ENST00000434982 PCID2Q5JVF3 399 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD55-202ENST00000434982 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD55-202ENST00000434982 SPESP1Q6UW49 350 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD55-202ENST00000434982 CES3Q6UWW8 571 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD55-202ENST00000434982 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD55-202ENST00000434982 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.04□□□□□ -1.12
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ANKRD55-202ENST00000434982 CARFQ8N187 725 aa8.04□□□□□ -1.12
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