RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 OR1D5P58170 312 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PFN3P60673 137 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TUBA4AP68366 448 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 B4GALNT1Q00973 533 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CASP8Q14790 479 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 DLG2Q15700 870 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SLC18A3Q16572 532 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 BIVMQ86UB2 503 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 C14orf79Q96F83 325 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MYH11P35749 1972 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 A8MU76 341 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 B4DGG1 531 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 F5H423 210 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 P4HA2O15460 535 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 CCDC172P0C7W6 258 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A1P53985 500 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN6O43657 245 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TRIAP1O43715 76 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CHRM3P20309 590 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MALP21145 153 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NUMBP49757 651 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF131P52739 623 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MYL6P60660 151 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 VSNL1P62760 191 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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