RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372146.4

GTF3C4-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C4, Length 9,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-201ENST00000372146 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 GKN3PP0CG01 181 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 CDH8P55286 799 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 IFI44LQ53G44 452 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 RIT1Q92963 219 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC19A2O60779 497 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PAHP00439 452 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PAEPP09466 180 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 MFSD5Q6N075 450 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 RHOJQ9H4E5 214 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SERPINF1P36955 418 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 TLR4O00206 839 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 CXCR3P49682 368 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 MPP1Q00013 466 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ZNF611Q8N823 705 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 HYKKA2RU49 373 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 TBX10O75333 385 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PRKCAP17252 672 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 IL32P24001 234 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FAM189A2Q15884 450 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PPM1JQ5JR12 505 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ELP3Q9H9T3 547 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 LRRC42Q9Y546 428 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 GOSR2O14653 212 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 NT5EP21589 574 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 BAG6P46379 1132 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PRELID2Q8N945 189 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 LGMNQ99538 433 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 CTPS1P17812 591 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SOX10P56693 466 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 GCNT1Q02742 428 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 TLE1Q04724 770 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 BORAQ6PGQ7 559 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PIGBQ92521 554 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 RELTQ969Z4 430 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 LRCH3Q96II8 777 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 STRA6Q9BX79 667 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 VWA7Q9Y334 891 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.99□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 HTD2P86397 168 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 RNF121Q9H920 327 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PTERQ96BW5 349 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ALKQ9UM73 1620 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 RAD51DO75771 328 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PRKCZQ05513 592 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 RAB39AQ14964 217 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SSX9Q7RTT3 188 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 C17orf64Q86WR6 236 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 GRHL3Q8TE85 626 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 IGKV5-2P06315 115 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 CHRNB1P11230 501 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 PRKXP51817 358 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 MFSD3Q96ES6 412 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.98□□□□□ -0.01
GTF3C4-201ENST00000372146 BDNFP23560 247 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms