RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364056.1

RNU6-960P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 960, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-960P, Length 120 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-960P-201ENST00000364056 PCDH7O60245 1069 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRAF2O60831 178 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 IGHV4-59P01825 116 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 EDN1P05305 212 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPIP06744 558 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 PLA2G4BP0C869 781 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SCG2P13521 617 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 EPCAMP16422 314 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 LBPP18428 481 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CA6P23280 308 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 PSMB4P28070 264 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 HOXC13P31276 330 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CAPZA1P52907 286 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 MTCP1P56278 107 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTENP60484 403 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TUBB4BP68371 445 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GTDC1Q4AE62 458 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 MPP7Q5T2T1 576 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 C20orf194Q5TEA3 1177 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM72DQ6L9T8 149 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 Q6ZTC4 211 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM72BQ86X60 149 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SETD6Q8TBK2 473 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 HEXDCQ8WVB3 486 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FBXO17Q96EF6 278 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 INTS14Q96SY0 518 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FN3KQ9H479 309 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRPV4Q9HBA0 871 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 RAB9BQ9NP90 201 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GAB2Q9UQC2 676 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TCF19Q9Y242 345 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 DISP3Q9P2K9 1392 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 A0A1W2PPW3 197 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FPGTO14772 594 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ARPC2O15144 300 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SOCS5O75159 536 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 RPS6KA5O75582 802 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM58BPP0C7Q3 252 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CEACAM1P13688 526 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 LHCGRP22888 699 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ITGA3P26006 1051 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 HSD17B3P37058 310 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 VAMP7P51809 220 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 BMXP51813 675 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CLDN15P56746 228 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GNB1P62873 340 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNJ10P78508 379 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 DLK1P80370 383 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 ROR1Q01973 937 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TAF13Q15543 124 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 NPTX1Q15818 432 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 EXT1Q16394 746 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TAZQ16635 292 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTGISQ16647 500 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 PHKG1Q16816 387 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPATA21Q7Z572 469 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 METTL23Q86XA0 190 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CNBD1Q8NA66 436 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 OR2T11Q8NH01 316 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 GIMAP5Q96F15 307 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPATA17Q96L03 361 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 RMDN2Q96LZ7 410 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 NDNQ99608 321 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 EGFL8Q99944 293 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 EDEM3Q9BZQ6 932 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-960P-201ENST00000364056 SNX25Q9H3E2 840 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms