RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 O00370 1275 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRID2O43424 1007 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX3O60493 162 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 DFFBO76075 338 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOCS3O95396 460 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 EML2O95834 649 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSRP00390 522 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PATE4P0C8F1 98 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDGFRAP16234 1089 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNAR1P17181 557 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNB4P30926 498 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP2K2P36507 400 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT5AP41221 380 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCIP41743 596 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEA11P43364 429 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAMP7P51809 220 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTCP1P56278 107 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERV-K104P61576 105 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBP5P82980 135 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPARDQ03181 441 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCN1BQ07699 218 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SQLEQ14534 574 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGCGQ16739 394 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf136Q5SQH8 315 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 C20orf194Q5TEA3 1177 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMC3Q5W041 872 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4A47Q6IF82 309 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA21Q7Z572 469 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM76AQ8TAV0 307 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM162AQ96A26 154 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIMAP5Q96F15 307 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2B2Q9GZK3 357 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPVLQ9H3G5 476 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPV4Q9HBA0 871 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRID1Q9ULK0 1009 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX7Q9UNH6 387 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF11O14901 512 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR46O15213 610 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6AP2O75787 350 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBAP04062 536 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPIP06744 558 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMBSP08397 361 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD48P09326 243 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRA2CP18825 462 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD27P26842 260 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRKLP46109 303 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLIPR1P48060 266 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 LBX1P52954 281 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLDN15P56746 228 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 BFSP1Q12934 665 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCARB2Q14108 478 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERC3Q15034 1050 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGISQ16647 500 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHEQ5VZ18 495 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM91A1Q658Y4 838 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF790Q6PG37 636 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 G2E3Q7L622 706 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM219AQ8IW50 185 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIGD4Q8IY51 512 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARVELD2Q8N4S9 558 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIPA2Q8N8Q9 360 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms