RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpat3Q8C0N2 438 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl3Q8C4V4 428 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc35e2Q8C811 405 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P3h2Q8CG71 703 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cnot6Q8K3P5 557 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dclre1cQ8K4J0 705 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam161aQ8QZV6 448 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lsm1Q8VC85 133 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr693Q8VF89 316 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr398Q8VFY0 314 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uts2rQ8VIH9 385 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ms4a10Q99N03 267 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp6cQ9CQR6 305 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cnot11Q9CWN7 505 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9CWU4 180 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fndc8Q9D2H8 321 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdrt4Q9DA64 179 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddi1Q9DAF3 408 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chrnb2Q9ERK7 501 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cbll1Q9JIY2 491 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smpd3Q9JJY3 655 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa9.01□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21885A0A286YDN8 145 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actl10A2AKE7 346 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Skint8A7XV07 398 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4871D3Z0W7 314 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcpp2E9PYC2 171 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp946F6VWU8 523 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcpp1L7N1X9 171 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RfngO09009 332 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cldn4O35054 210 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fkbp7O54998 218 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd8aP01731 247 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxa9P09631 271 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GhrP16882 650 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 M6prP24668 278 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HalP35492 657 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnj5P48545 419 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BckdhaP50136 442 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ube2e3P52483 207 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GuloP58710 440 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc10a2P70172 348 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EpycP70186 322 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NficP70255 439 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnj13P86046 360 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DtlQ3TLR7 729 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc58Q3UGP9 366 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc22a23Q3UHH2 689 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syndig1lQ3USQ7 237 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc160Q3UYG1 323 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbm44Q3V089 1013 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ampd1Q3V1D3 745 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp791Q497V9 528 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actr3bQ641P0 418 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rftn1Q6A0D4 554 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhga7Q6DD96 935 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zzz3Q6KAQ7 910 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl19Q6PB97 674 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PapolgQ6PCL9 739 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp324Q78F42 583 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r38Q7TQA6 331 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1344Q7TQV3 321 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sgo2Q7TSY8 1164 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Carnmt1Q80UY1 400 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppm1lQ8BHN0 360 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CyrenQ8BHZ5 157 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb46Q8BID6 600 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efemp1Q8BPB5 493 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sumf2Q8BPG6 308 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc151Q8BSN3 593 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pithd1Q8BWR2 211 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cep57Q8CEE0 500 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rdh13Q8CEE7 334 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CenpiQ8K1K4 746 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hid1Q8R1F6 788 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc5a9Q8VDT1 685 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr357Q8VFP4 308 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usb1Q91W78 267 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem150aQ91WN2 271 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dio3Q91ZI8 304 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Catsper1Q91ZR5 686 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm26657Q9CVR1 127 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wars2Q9CYK1 360 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rsph14Q9D3W1 341 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rcan2Q9JHG2 197 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nupr1Q9WTK0 80 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LipaQ9Z0M5 397 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Elf4Q9Z2U4 655 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SpegQ62407 3262 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms