RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C1qtnf3Q9ES30 246 aa12.67□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cbll1Q9JIY2 491 aa12.67□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adam23Q9R1V7 829 aa12.67□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adamts20P59511 1906 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cyp2a22B2RXZ2 492 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P01664 111 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Surf2P09926 257 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eno2P17183 434 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bcl2a1Q07440 172 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q32M26 199 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dnajc11Q5U458 559 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim50Q810I2 483 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdh7Q8BM92 785 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Anapc2Q8BZQ7 837 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdia5Q921X9 517 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pacsin3Q99JB8 424 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hhipl2Q9D2G9 717 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plxna2P70207 1894 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wsb2O54929 404 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Togaram2Q3TYG6 1002 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm14226Q3TZL0 686 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Akt2Q60823 481 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gstt2Q61133 244 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nr6a1Q64249 495 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prr14Q7TPN9 612 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1344Q7TQV3 321 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ChfrQ810L3 664 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pih1d2Q8CHR9 315 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Serpinb10Q8K1K6 397 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dio3Q91ZI8 304 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zbp1Q9QY24 411 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vnn3Q9QZ25 500 aa12.66□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Actl10A2AKE7 346 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MipepA6H611 711 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Xkr6E9Q6C8 638 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dgcr6O35347 198 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PdynO35417 248 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sod2P09671 222 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d10aP58802 500 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Actr1aP61164 376 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MybphP70402 483 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 UrodP70697 367 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Axdnd1Q3UZ57 424 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Xkr9Q5GH62 373 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr381Q5SSP0 311 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nr0b2Q62227 260 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lats2Q7TSJ6 1042 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nrde2Q80XC6 1172 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eme1Q8BJW7 570 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mblac2Q8BL86 279 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Myoz3Q8R4E4 245 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Actr1bQ8R5C5 376 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1302Q8VGE9 315 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1414Q8VGU5 312 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr659Q8VGV6 322 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 EdaraddQ8VHX2 208 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krcc1Q99JT5 256 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MispQ9D279 648 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc28a3Q9ERH8 703 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HemgnQ9ERZ0 503 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdkl2Q9QUK0 568 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Katna1Q9WV86 491 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fer1l5P0DM40 2038 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr634-ps1A0A1B0GRN7 318 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp352A2AML7 551 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mcpt1P11034 246 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Taar7bQ5QD11 358 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tyw1Q8BJM7 721 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adap2Q8R2V5 381 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rpe65Q91ZQ5 533 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab28Q99KL7 221 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr701Q9D3U9 316 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plscr1Q9JJ00 328 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cul3Q9JLV5 768 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AtmQ62388 3066 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Faap100A2ACJ2 879 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r3A2AMT7 306 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Skint1A7TZE6 364 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Srp72F8VQC1 671 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CatP24270 527 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pxmp2P42925 194 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tnfsf4P43488 198 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Epb42P49222 691 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbpl1P62340 186 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 VclQ64727 1066 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem151bQ68FE7 561 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf728Q6P5C7 752 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q8CIL4 281 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 85.4 ms