RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Amdhd1Q9DBA8 426 aa9.97□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Htr3bQ9JHJ5 437 aa9.97□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Upk3aQ9JKX8 287 aa9.97□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lipo4D3Z608 396 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Izumo4D3Z690 227 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AF366264G3X9P9 502 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pabpc4lG5E8X2 370 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r6H3BK29 913 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phxr1P15973 60 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lzts1P60853 599 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arl1P61211 181 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam117bQ3U3E2 584 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Armc5Q5EBP3 926 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itga2Q62469 1178 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adamts16Q69Z28 1222 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tgm6Q8BM11 706 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp57Q8C6P8 421 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Art4Q9CRA0 300 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IL36RNQ9QYY1 156 aa9.96□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm21885A0A286YDN8 145 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aldoart2A6ZI47 364 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem240B2RWJ3 173 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Htr5bP31387 370 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zic1P46684 447 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnj5P48545 419 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NadkP58058 439 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aup1P70295 410 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galnt3P70419 633 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akr1c6P70694 323 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cxcr5Q04683 374 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdk18Q04899 451 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lingo4Q149C3 593 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lpcat1Q3TFD2 534 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr149Q3UVY1 732 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr325Q5NCD2 326 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem199Q5SYH2 208 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp7Q6A4J8 1103 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plekha6Q7TQG1 1173 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubp1Q811S7 540 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Susd6Q8BGE4 302 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrip1Q8CBD1 1161 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem221Q8K071 230 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Agfg1Q8K2K6 561 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gramd1aQ8VEF1 722 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Camk1gQ91VB2 477 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Diras1Q91Z61 198 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MvdQ99JF5 401 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd61Q9CQM6 421 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lsm7Q9CQQ8 103 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CutalQ9D1U5 156 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acsl4Q9QUJ7 711 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DguokQ9QX60 277 aa9.96□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SmoktcrA2KF29 484 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm20441G3UYJ7 252 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm2888K7N746 267 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6502L7N456 481 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnk1O08581 336 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sbk2P0C5K1 362 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myf6P15375 242 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CratP47934 626 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Resp18P47939 175 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EndouQ3V188 412 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc23a3Q60850 611 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptx4Q6RUU0 478 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas2r38Q7TQA6 331 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1152Q7TR34 310 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf423Q80TS5 1292 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbbp8Q80YR6 893 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab15Q8K386 212 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1263Q8VG63 306 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DgkgQ91WG7 788 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MINDY3Q9CV28 444 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EbplQ9D0P0 206 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr89Q9D0R9 386 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grb14Q9JLM9 538 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r238E9Q373 306 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1600015I10RikE9Q745 711 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6356L7N2A7 188 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ClppO88696 272 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp21P03940 487 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AldocP05063 363 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps14P62264 151 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc10a7Q5PT53 340 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11992Q5SS90 291 aa9.95□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ei24Q61070 340 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.1 ms