RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019638.14

Cops6-201, Transcript of COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cops6, Length 1,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6-201ENSMUST00000019638 Tmigd1Q9D7L8 261 aa16.09■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 SqorQ9R112 450 aa16.09■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 NsdhlQ9R1J0 362 aa16.09■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 2210016F16RikG3X8U3 338 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Epha8O09127 1004 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Rps17P63276 135 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 RalgdsQ03385 852 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Arhgap44Q5SSM3 814 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Slc6a3Q61327 619 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 PolnQ7TQ07 864 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 PdprQ7TSQ8 878 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Prkaa2Q8BRK8 552 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Cyp2j9Q924D1 502 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Lrrc4Q99PH1 652 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Clca1Q9D7Z6 913 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Slc13a1Q9JHI4 594 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 DonsonQ9QXP4 560 aa16.08■□□□□ 0.17
Cops6-201ENSMUST00000019638 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Cped1B2RX70 1026 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Trove2O08848 538 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 E2f3O35261 457 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Slc1a6O35544 561 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Zw10O54692 779 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Diaph2O70566 1098 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 AurkcO88445 282 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Bmp2P21274 394 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 BckdhaP50136 442 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 OstnP61364 130 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Ube2iP63280 158 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Olfr1051Q7TR76 308 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 AopepQ8BXQ6 817 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Atg16l1Q8C0J2 607 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Grhl2Q8K5C0 625 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 ItpkaQ8R071 459 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Erlec1Q8VEH8 483 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Ppp6cQ9CQR6 305 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Atp5dQ9D3D9 168 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Pnp2Q9D8C9 305 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Fiz1Q9WTJ4 500 aa16.08■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Ssxb6A2BI74 170 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Cisd3B1AR13 137 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Chst13D3Z6E3 336 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Susd5G3UW60 619 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Tmco2P0C1V4 183 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 MdkP12025 140 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Hoxa2P31245 372 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Abce1P61222 599 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 NptnP97300 397 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Q3U6N9 222 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Foxk2Q3UCQ1 651 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Grid2Q61625 1007 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Gucd1Q8BZI6 239 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Cabs1Q8C633 391 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Stbd1Q8C7E7 338 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 RydenQ8CAK3 290 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Wdr47Q8CGF6 920 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 BtdQ8CIF4 520 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Trnt1Q8K1J6 434 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 TgdsQ8VDR7 355 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Olfr394Q8VGR5 310 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Dtwd1Q9D8U7 304 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 C1qtnf3Q9ES30 246 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Trpc4apQ9JLV2 797 aa16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 HelzQ6DFV5 1964 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Kpna7C0LLJ0 499 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Zfp607bG3X9H3 648 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Agtr2P35374 363 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 LdlrP35951 862 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Emp1P47801 160 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Prmt9Q3U3W5 846 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 E330014E10RikQ3UL33 481 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 D5Ertd577eQ499F0 481 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Itm2aQ61500 263 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Dusp23Q6NT99 150 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Fbxl19Q6PB97 674 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 PrlhrQ6VMN6 370 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Uts2bQ765I1 113 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Galnt7Q80VA0 657 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Rhox11Q810N8 206 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Cpped1Q8BFS6 312 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Trim35Q8C006 501 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Olfr1302Q8VGE9 315 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Olfr351Q8VGK1 310 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Golga7Q91W53 137 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Hdac11Q91WA3 347 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Pdia5Q921X9 517 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Pcbd2Q9CZL5 136 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Slc52a3Q9D6X5 460 aa16.06■□□□□ 0.16
Cops6-201ENSMUST00000019638 Pdcd7Q9WTY1 482 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms