RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 KRT87PA6NCN2 255 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 GFYI3L273 518 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 TUBB4AP04350 444 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 ITGB2P05107 769 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 ITGA1P56199 1179 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CAV1Q03135 178 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 PCSK4Q6UW60 755 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CPNE9Q8IYJ1 553 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 IL17BQ9UHF5 180 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CROTQ9UKG9 612 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 TK2O00142 265 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 MAGP20916 626 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 DLSTP36957 453 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 MGAT5Q09328 741 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 DNAJC22Q8N4W6 341 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 ZFATQ9P243 1243 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPV9 198 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 H3BMH7 237 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CYP2A7P20853 494 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 F8A1P23610 371 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 MCM3P25205 808 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 HSD17B2P37059 387 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CDKN2DP55273 166 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 SF1Q15637 639 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 FAM20CQ8IXL6 584 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 KCND3Q9UK17 655 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 KLK4Q9Y5K2 254 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-220ENST00000618056 C21orf140B9A014 251 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 E7EQ34 232 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 HCRTR1O43613 425 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 ZBTB14O43829 449 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 RGS4P49798 205 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 CYP4F2P78329 520 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 MC1RQ01726 317 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 GPS2Q13227 327 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 SPNS2Q8IVW8 549 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 GPR135Q8IZ08 494 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 OR2A1Q8NGT9 310 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 CT55Q8WUE5 264 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 STARD8Q92502 1023 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 ZUFSPQ96AP4 578 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 PKP4Q99569 1192 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 CFAP46Q8IYW2 2715 aa23.95■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 TARM1B6A8C7 271 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 RORAP35398 523 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FIGLAQ6QHK4 219 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 SMPDL3AQ92484 453 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FAM117AQ9C073 453 aa23.94■■□□□ 1.42
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PMS1-220ENST00000618056 PSAT1Q9Y617 370 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 SPTA1P02549 2419 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 ZNF839A8K0R7 811 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 OR2B3O76000 313 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 HBQ1P09105 142 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 TCN2P20062 427 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FDXRP22570 491 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 PSMB5P28074 263 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 PLTPP55058 493 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 DNASE1L3Q13609 305 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 HECTD2Q5U5R9 776 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 C8orf74Q6P047 294 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 DSELQ8IZU8 1212 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 OR2L3Q8NG85 312 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-220ENST00000618056 FBXO25Q8TCJ0 367 aa23.94■■□□□ 1.42
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