RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 AOAHP28039 575 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 NPY2RP49146 381 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TTPAP49638 278 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CSRP3P50461 194 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ITGA1P56199 1179 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TLE1Q04724 770 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MSS51Q4VC12 460 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PDIK1LQ8N165 341 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 KIFC1Q9BW19 673 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 BFARQ9NZS9 450 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 A0A0J9YY10 115 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 E7EQ34 232 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 DNAJB5O75953 348 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SLCO2B1O94956 709 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MAGEA3P43357 314 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MAGEA4P43358 317 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 KCNC4Q03721 635 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 KYNUQ16719 465 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MPP5Q8N3R9 675 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MFSD3Q96ES6 412 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TCTN2Q96GX1 697 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TLK1Q9UKI8 766 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FLNCQ14315 2725 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MED13Q9UHV7 2174 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 AP3B1O00203 1094 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MAP3K7O43318 606 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF749O43361 778 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 APOA4P06727 396 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CTSBP07858 339 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MLNP12872 115 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CASRP41180 1078 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RAB28P51157 221 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 KIR2DS3Q14952 304 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 BBS9Q3SYG4 887 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CPZQ66K79 652 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CES3Q6UWW8 571 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 THAP4Q8WY91 577 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 NLNQ9BYT8 704 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 HECTD1Q9ULT8 2610 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RIPK2O43353 540 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 AVILO75366 819 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PDGFAP04085 211 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 IQCKQ8N0W5 287 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 IL17FQ96PD4 163 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ZIM3Q96PE6 472 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TCFL5Q9UL49 500 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SOX13Q9UN79 622 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SNX7Q9UNH6 387 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ISM1B1AKI9 464 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A39-216ENST00000592857 KDM1AO60341 852 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A39-216ENST00000592857 VAPBO95292 243 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A39-216ENST00000592857 TTC4O95801 387 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A39-216ENST00000592857 TMED2Q15363 201 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A39-216ENST00000592857 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A39-216ENST00000592857 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms