RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC41A2Q96JW4 573 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMRAL1Q9HBL8 299 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 OARD1Q9Y530 152 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 JMJD7P0C870 316 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 NELFEP18615 380 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 OAS2P29728 719 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMPRP36959 345 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YY10 115 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 E7ENX8 843 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 HGFP14210 728 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAP2Q03519 686 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXR1Q6PIV2 292 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM129CQ86XR2 697 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDRPQ86YL5 185 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1191Q96A73 305 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPV9 198 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 FKBP9O95302 570 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSD11B2P80365 405 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKL1Q00532 357 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLG1Q12959 904 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASA2Q15283 850 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM83EQ2M2I3 478 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUSD1Q6UWL2 747 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIFABQ6ZNK6 161 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRA10AC1Q70Z53 315 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPFIBP2Q8ND30 876 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCTD4Q8WVF5 259 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS11Q9H270 941 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGSF5Q9NSI5 407 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS20P59510 1910 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2P1A4D2B8 440 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB7A8K855 629 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 GUCA1CO95843 209 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITIH1P19827 911 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL4DP49703 201 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF9Q00978 393 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SF1Q15637 639 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGTRAPQ6RW13 159 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGF2-ASQ6U949 168 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSMEM2Q8N112 164 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2A1Q8NGT9 310 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATL1Q8WXF7 558 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTERQ96BW5 349 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 NXNL1Q96CM4 212 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OCIAD1Q9NX40 245 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PISDQ9UG56 409 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBK1Q9UHD2 729 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTRCQ9Y297 605 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4E171 279 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL2O95198 593 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL4P13236 92 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST6GAL1P15907 406 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN7P41732 249 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM73Q86UV7 250 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMPERQ8N8U9 685 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATA6Q92908 595 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 AK5Q9Y6K8 562 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH16O75309 829 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA5P08758 320 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFEBP19484 476 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMB5P28074 263 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLCO1A2P46721 670 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGFBIQ15582 683 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISCA2Q86U28 154 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAG3L4Q8TBR4 150 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL8Q96CD0 374 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABS1Q96KC9 395 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOHLH2Q9NX45 425 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC189A1A4V9 331 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP3K7O43318 606 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERLIN1O75477 346 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 DXOO77932 396 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PVRP15151 417 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFFO1Q0D2I5 559 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4D1Q15615 310 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 D2HGDHQ8N465 521 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2L3Q8NG85 312 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2W6PQ8NHA6 318 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC46A1Q96NT5 459 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG9Q9H6U8 611 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC151A5D8V7 595 aa31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms